撒麻耳干之役
撒麻耳干是花剌子模的新都，是花剌子模政治经济中心，幅员辽阔，土地肥沃，人口众多，而且地处重塞，军事地位极为重要。堂堂首都，摩诃末不敢掉以轻心，虽然撒麻耳干城的防御已经很牢固了，虽然撒麻耳干的守兵多得无以计数，摩诃末还是亲自率了11万主力据守，并且还弄来了几十头大象作为战场上的防护。
重兵把守，牢固的防御设备，撒麻耳干城看上去固若金汤，坚不可摧，但摩诃末却忧心忡忡，老担心蒙古大军的势力不可阻挡，老担心城破人亡的命运马上就会降临到他头上。交战尚未开始，他的心理防线早被成吉思汗的声威攻破了。他日日叹息，消极的情绪影响着他身边的每一个人，令全城军民的抗战情绪一落千丈，蒙古大军还没到，撒麻耳干城内城外早笼罩着一种消极悲观的气氛，什么战斗力，什么坚守首都，都成了空话一句。
成吉思汗的大军离撒麻耳干不远了，城中的摩诃末已经可以感觉到那地动山摇的气势，那不可阻挡的声威，他动摇了，他怯懦了，他后退了。他叹道：“敌军兵锋甚锐，我不能呆在这里。”遂率主力匆匆逃离此城，只留下了4万兵力守卫新都。
然而成吉思汗并不知道撒麻耳干城的内情，在他心目中，撒麻耳干城依然是人们传说的那样：守军人数众多，数不胜数，城堡防守严密，坚不可摧。因而成吉思汗是把撒麻耳干城当作一个硬骨头来对待的。
兵临撒麻耳干城下，成吉思汗并不急于攻城，他先绕着城池巡视，勘察地形，了解敌军的守备情况，此时，他才知道摩诃末已经弃城而逃了，摩诃末身为国君，敌军来犯，不仅不身先士卒，率众抵抗，反而散布消极情绪，弃城而逃，撒麻耳干城军民的情绪肯定会受到很大影响，战斗力也会大大减弱，如此一来，蒙古军队遇到的抵抗就会减弱好多。成吉思汗夺城的信心更足了。
但是摩诃末却不能放过。成吉思汗一面抓紧攻城前的准备工作，一面派大将哲别、速不台速速率领精骑昼夜追击摩诃末。成吉思汗命令他们要穷追勿舍，沿途诸城，降者安抚之，抗者摧破之，就是追到天涯海角，也不能放过摩诃末。哲别、速不台受命追击摩诃末，不敢拖缓，日夜兼程地朝着摩诃末逃跑的方向追去。
一切准备工作都安排妥当了，术赤押来俘虏数万，成吉思汗以这些花剌子模俘虏为先锋，蒙古军队督后，箭、炮齐下，20多万人轮班攻城。
蒙古大军用火炮轰击城池各门，使花剌子模士兵困在城内出来不得，同时，成吉思汗命令一队人马趁守军对火炮防不胜防的时候，冲入撒麻耳干城的外城，守军大多都退到内城即城堡中去了，见外城失守，想冲出来抵抗，但都被火力抵挡回去了。成吉思汗先用火力稳住城堡的局势，然后不慌不忙地将外城残存的守军击溃。城堡中的守军冲不出火炮的重围，不能与蒙古军队正面交锋，他们想起了摩诃末在城时弄来的几十头大象，于是他们给大象披上铁甲，在大象的掩护下，他们冲出了城堡，指挥着大象向蒙古军队发起攻击。蒙古诸将什么东西没见过，这些庞然大物也能吓得了他们？他们沉着地指挥士兵朝大象的头部、脚部射击，士兵们在他们坦然自若的神情的影响下，也稳定了慌乱的情绪，充分发挥他们的射击水平，朝着那一群庞然大物连连发箭，众大象在箭雨中狂奔不已，企图冲回城堡，反而将花剌子模的士兵踩死了不少。
初次与蒙古军队交锋，撒麻耳干的军民就尝尽了苦头。思虑再三，他们决定向成吉思汗的大军投降。
次日，撒麻耳干西北门大开，降军迎蒙古军入城。成吉思汗入城后的第一道命令就是拆毁城墙和外垒，便于蒙古大军畅通无阻，然后下令将驻扎在撒麻耳干城的花剌子模官兵全部杀死，城中有手艺的居民被挑选出来，分配到蒙古各军中，其余的居民交出了巨额赎金以后，也保全了性命。
花剌子模的新都既已被成吉思汗所得，征服花剌子模不过是迟几天早几天的事了，西征胜利在望，成吉思汗的心情轻松了许多，连日征战，将士们已经很疲惫了，成吉思汗命令就地休养，调整士气。
摩诃末之死
哲别、速不台奉命追击摩诃末，不敢有丝毫的疏忽，摩诃末逃亡途中，不断散播失败投降之类的消极情绪，沿途的军民对这个国君十分失望，他们心想：连国君都不想保国了，我们还给谁保国卫家呢？死守死战又有什么用处呢？叛花投蒙的情绪笼罩着摩诃末逃跑的沿途各地区，有关摩诃末的行踪也不断传到蒙古追兵那里。
摩诃末从撒麻耳干离开后，昼夜不息地逃跑，渡过阿姆河后，他召集部下开了一个会，悲观情绪已经由君主传到了每一个人，除了摩诃末的长子札阑丁，在诸将或主张求助于外来势力，或主张逃亡下去各种意见左右了摩诃末的思绪之后，他再三请求摩诃末，召集各路花剌子模兵力，集中反击蒙古势力，他相信凭着花剌子模的实力，是可以跟成吉思汗拼一拼的。
但是摩诃末心里已经被逃跑情绪占领了，“逃命要紧，逃命要紧！”他心里再也容不下任何抗战的话语，对于扎阑丁的请求，他叱之以目：“你知道什么！吉凶之势，由天注定，也是你能改变的了的？小小年纪，不知天高地厚，狂妄！”札阑丁苦苦哀求他以国民为重，据守阿姆河，争得形势的转机，摩诃末被他说得不耐烦，打发他增守旧都玉龙杰赤去了。
主战的札阑丁一走，摩诃末所率的部队失去了生机，几万人马没精打采、零零散散地屯集在阿姆河畔，等待摩诃末命令的下达。对于部将们提出的种种逃亡路线，摩诃末举棋不定、犹豫不决之时，哲别的轻骑已经在阿姆河对岸出现，正准备渡河了！
花剌子模士兵如同见了天兵天将，吓得抱头鼠窜，什么营帐、兵器、全顾不上收拾了，几万主力，一下子作鸟兽散，分散于各城镇乡村，留在摩诃末身边的军队越来越少，诸城失陷的消息纷纷传来，军心动摇，各王公贵族又各自领兵弃摩诃末而去。
哲别渡过阿姆河后，沿着摩诃末的足迹紧追不息，越过了高山，越过了河谷，蒙军势在必得的气势让摩诃末越来越心惊胆战。他们一行如丧家之犬，昼夜逃窜，突然，河对岸又出现了蒙古军的大队人马，隔河相望，那骇人的架势竟如同成吉思汗亲临，原来，是速不台率领另一队人马也追上来了！
万分恐惧的摩诃末马不停蹄地向巴里黑逃去，到巴里黑之后，强烈的恐惧让他夜不能寐，来不及休整队伍，他又走上了逃亡之路。哲别、速不台尾随其后，到达了巴里黑城，巴里黑的城民主动献城，而且还选派了熟悉路径的人做向导，带领蒙古军队去追击他们那置国民安危于不顾，只顾自己逃命的国君。既然国君对臣民不仁，臣民对国君也要不义了！
在向导的指引下，追击的进程快了许多，对于沿途各城，自动降服的，城民就得以活命，顽抗不降的，都遭到了被杀戮、劫掠的命运，蒙古大军一路势如破竹，摩诃末身后的城镇纷纷落入了蒙军之手。
摩诃末辗转于各地，怎么也摆脱不了被追杀的命运，后来，他逃到了宽田吉思海（今里海）的一个小岛上，跟随的将士死的死、逃的逃，此时只剩下了几个贴身侍卫，一路只顾逃命，行李丢了也不敢收拾，到岛上之后他们缺衣少食，靠沿岸居民的接济过活。
摩诃末忧愤交加，整日神智错乱，含糊不清，不久患了胁膜炎，没有药品，环境又差，摩诃末的病势在一天天加重。后来，他听说他心爱的嫔妃被送进了成吉思汗的军帐，他的母亲秃儿罕可敦成了成吉思汗的俘虏，他昔日饮酒作乐的皇室成了一片废墟，他的精神彻底崩溃了，不久，就死在了小岛上，他的侍卫用他的衣衫将他裹了葬了。
怎么说，摩诃末也算个称雄一世的人物，鼎盛之时，连成吉思汗都对他忌惮几分，但他外强中干，又笃信天命，面对蒙古大军的进犯，他不是率领全国民众奋力反击，而是步步后退，放弃城堡，放弃国民，终于落得如此之下场。是可悲，还是罪有应得？这得由历史来解释。
尾声
新都已破，国君亦亡，花剌子模国灭亡的命运就在眼前！
但花剌子模还有一个旧都玉龙杰赤，还有新王札阑丁、勇将帖木儿灭里，还有无数将士在作最后的挣扎。
尤其是玉龙杰赤之战，花剌子模从将军到士兵，都显示出了临死不屈、誓死力争的英雄气概。
札阑丁到玉龙杰赤后，和帖木儿灭里同心协力，多次打退了蒙古大军的进攻，后来玉龙杰赤城内乱，一部分反叛势力企图废掉新王札阑丁，札阑丁愤然出走，帖木儿灭里亦不离左右。他们穿越沙漠，和一部分蒙古军队遭遇，札阑丁、帖木儿灭里奋勇出击，打退了蒙古军队，然后以最快的速度开往国境南端的哥疾宁。他们在哥疾宁招集人马，组织了6万多兵力，主动攻击蒙古军队，竟然以少胜多，大伤蒙古铁骑的锐气。成吉思汗遭到如此顽强抵抗，勃然大怒，亲自率了大军前往哥疾宁捉拿札阑丁，札阑丁弃城南走，兵败申河（今印度河），士兵人数在减少，锐气却在增加，成吉思汗爱才之心遂起，令手下不可伤其性命，要活捉。札阑丁在乱军之中方得以活命，后跳岸落水，泅水而去。成吉思汗见状，发出了由衷的感叹：“札阑丁，良将也，是唯一打败过我蒙古大军的将军！你等……”，他转向他身后的部将，“要以他为榜样！”
札阑丁既走，帖木儿灭里孤掌难鸣，成吉思汗西征的强硬对手逐渐失去了锋芒。
再说那玉龙杰赤。自札阑丁与帖木儿灭里走后，城中群龙无首，后来军兵推荐了摩诃末母后的亲信忽马儿异密为首，立为诺鲁思王，诺鲁思王并非将才，对于指挥作战，他并不精通，偌大一个旧都玉龙杰赤交到他手里，他竟手忙脚乱起来。玉龙杰赤守卫战在他的统领下，缺乏计划、步骤，没有条理性，攻击时骑兵、步兵、战士、民众，皆一涌而上，商定决议时，将士、百姓七嘴八舌，难以形成定论。玉龙杰赤城的抗战情绪非常高昂，但这种高昂的情绪却没有被诺鲁思王很好地利用起来。这种形势对于蒙古军队来说，应该是很有利的，偏偏蒙军统帅术赤与察合台不和，号令不一，令全军将士无所适从，因而劳师无功，半年时间都快过去了，玉龙杰赤城还没攻下来。成吉思汗闻讯大怒，改任窝阔台为主帅，让他协调术赤与察合台的行动。窝阔台一上任，情形大为转机，在他的统一领导下，蒙古大军的步伐齐整了，行动一致了，玉龙杰赤城很快就归属了成吉思汗。
新、旧都皆破，诸城皆归，花剌子模国成了蒙古兵的天下。曾称霸一时的花剌子模国，终归还是不敌成吉思汗的炮火。
1222年夏，各路军队汇集于八鲁湾避暑地，成吉思汗待诸将到齐，便凯旋回国了！